من أجل حماية سلام وسلامة اليابان من الكائنات الوحشية العملاقة الغامضة، تم تطوير روبوتات شينكانسين المتحولة، “شينكاليونز“، والتي تم تطويرها بواسطة مؤسسة “شينكانسين فائقة التطور“.الآن، استعدادًا لهجوم أعداء جدد، يقوم المعهد بتطوير نوع جديد من الروبوتات يسمى “شينكاليوز زد“، بالإضافة إلى مركبات تعزيز مسلحة جديدة تسمى “زايلينرز” والتي تتحول من القطارات التقليدية لتزويد “شينكاليوز زد” بالطاقة.سيعمل الفتية الذين أصبحوا سائقي “شينكاليوز زد” بمعدل متوافق مرتفع مع موظفي المعهد لمواجهة الوحوش العملاقة التي عادت للظهور.